关于主动离职是否扣工资合法，这需根据具体情况判断。一般而言，如果员工主动离职且没有违反公司相关规定，公司无权扣除工资。但如果员工离职是因为公司存在违法行为，员工有权提出解除劳动合同并获得相应补偿。
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员工主动离职时，双方可通过协商解除合同或员工单方面解除合同。若用人单位无违法行为，员工主动离职一般不会涉及工资扣除。但若涉及用人单位违法情况，员工可单方面解除劳动合同并可能获得经济补偿。具体情况需结合相关法律法规进行实际操作。
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关于主动离职扣工资问题，重点在于是否存在用人单位的违法行为。如用人单位无过错，员工主动离职不会扣工资；若用人单位存在违法行为导致员工离职，员工有权要求经济补偿。因此，处理方式应根据实际情况选择，包括协商解除或单方面解除，并可能涉及劳动仲裁或法律诉讼。